2009 yılından bu yana hastane bünyesinde Tıbbi Onkoloji kliniğine bağlı olarak hizmet veren kemoterapi ünitesi; Çanakkale Mehmet Akif Ersoy Devlet Hastanesi binasında ayaktan hastalara hizmet vermektedir.

Tıbbi onkoloji polikliniği ve kemoterapi ünitesi hastanesinde yataklı servisler B blok zemin katında bulunmaktadır.

Kemoterapi Ünitesinin çalışması ile ilgili olarak detaylı bilgiler veren hastane başhekimi Op. Dr. Ufuk Tali şunları söyledi: “Birimimizde 1 İç Hastalıkları ve Tıbbi Onkoloji Uzmanı, 5 hemşire, 1 biyolog ve 2 sekreter olarak hizmet verilmektedir. Ünitede kemoterapi ilaçları yarı otomatik sistem ile hazırlanmaktadır. Kemoterapi ünitesinde ayda ortalama 450-500  hasta hizmet almaktadır. Erişkin Hematoloji ve Romatoloji hastalarının bazı tedavileri de ünitede hali hazırda uygulanmaktadır.

Tıbbi Onkoloji bölümünün tedavi alanı içerisinde olan  hastaların öncelikle İç Hastalıkları ve Tıbbi Onkoloji uzmanı Dr. Erdem ŞEN tarafından değerlendirilip hastalığın tanısı, evresi ve tedavi planı açısından bilgilendirilmektedir. Hasta ve yakınlarına tedavi öncesi kemoterapi hakkında eğitim verilerek kemoterapinin olası yan etkileri ve bunlara karşı alınacak önlemler hakkında bilgi verilmektedir. İç Hastalıkları ve Tıbbi Onkoloji uzmanı tarafından tedavisi planlanan hastaların geniş ve ferah bir ortamda tv izleyerek dilerse müzik dinleyerek tedavilerini almaktadırlar.”